Casa di Cura Ambrosiana è una società di capitali controllata al 100% da Fondazione Sacra Famiglia.
È gestita dal Consiglio di amministrazione, il quale compie tutte le operazioni necessarie per l'attuazione dell'oggetto sociale. Il Consiglio, composto da quattro membri, governa i temi organizzativi e gestionali della Società. I consiglieri restano in carica per tre esercizi.
Il Consiglio, qualora non abbia provveduto l'Assemblea, nomina un Presidente, al quale sono attribuite funzioni generali di vigilanza, indirizzo e coordinamento.
Il Consiglio di amministrazione può nominare un Direttore generale, che ricopre le funzioni direttive e propone i direttori a capo alle varie sezioni dell'Ente.
La azioni del Consiglio sono sottoposte al controllo di un Organismo di vigilanza composto da tre membri.
Il Collegio sindacale vigila sull'osservanza della legge e dello statuto e sul rispetto dei principi di corretta amministrazione. È eletto dall'Assemblea dei Soci ed è composto da tre membri effettivi e due supplenti.
Tutti i membri del Collegio durano in carica per tre esercizi fiscali e sono rieleggibili.
Casa di Cura Ambrosiana si avvale infine della società di revisionecontabile EY S.P.A. per l'espletamento delle funzioni di controllo e vigilanza contabile sancite dagli artt. 2409 ter e ss. cod. civ. e dalla DGR Lombardia n. IX/4606 del 2012.